2019年12月9日，来自英国的 Pedro Beltrao 和 David Ochoa 在 Nature Biotechnology 杂志上发表文章 The functional landscape of the human phosphoproteome，创建了参考磷酸化蛋白质组图谱和功能图谱。从104种不同的人类细胞类型或组织中人工收集112个富含磷酸化的蛋白质数据集，并重新分析6801个蛋白质组学实验，建立出质量控制标准，创建了一个含有119809个人类磷酸化位点的参考磷酸化蛋白质组图谱。利用机器学习对59个蛋白质组、结构相关、调控相关、进化等相关的特征进行整合分析，得到综合性的功能评分，以此建立出磷酸化蛋白的功能图谱，并鉴定出不同分子机制、生理过程和疾病中的调节性磷酸化位点。
1. Sharma, K. et al. Ultradeep human phosphoproteome reveals a distinct regulatory nature of Tyr and Ser/Thr-based signaling. Cell Rep. 8, 1583–1594 (2014)2. Hornbeck, P. V. et al. PhosphoSitePlus, 2014: mutations, PTMs and recalibrations. Nucleic Acids Res. 43, D512–D520 (2015).3. Torres, M. P., Dewhurst, H. & Sundararaman, N. Proteome-wide structural analysis of PTM hotspots reveals regulatory elements predicted to impact biological function and disease. Mol. Cell. Proteomics15, 3513–3528 (2016).
